Das städtische Museum mit dem Heilig-Geist-Spital liefert anschauliches Hintergrundwissen und umfangreiche Einblicke in die Stadtgeschichte.
Neben wertvoller sakraler und profaner Kunst lassen sich hier unter anderem Autographen und Werkausgaben heimischer Mundartdichter, eine archäologische Sammlung sowie bäuerliche Werkzeuge und alte Werkstatteinrichtungen früherer Handwerker bestaunen.
In der ehemaligen Spitalkapelle sind gotische und manieristische Wandmalereien sowie hervorragende Beispiele kirchlicher Plastik zu sehen.
In der geologischen Abteilung des Museums Ehingen werden farbenprächtige Darstellungen des Jurameeres gezeigt. Regionale Gesteine und ihre wirtschaftliche Bedeutung in der Region sind zudem in einem fundierten Themenrundgang durch die Stadtmitte Ehingens erlebbar.